از زمان معرفی آن در دهه 1970، تجزیه و تحلیل میکروبی دستخوش توسعه و بهبود مستمر بوده است. در ابتدا، تجزیه و تحلیل میکروبی عمدتاً برای تشخیص نمونههای محیطی مورد استفاده قرار گرفت و بعدها به تدریج در زمینههای پزشکی، کشاورزی، مهندسی زیستی و غیره گسترش یافت. روش تحلیلی
